とりあえずQuantumEspressoで吸着計算をやってみた!(入力ファイル編)


入力ファイルを作成以下のように入力ファイルを作成する。いろいろな座標系や他のオプションもある。入力ファイルの拡張子は.inでであるので注意。テキストエディターもしくはメモで作成してその後に名前の変更で拡張子を変える(.txtから.in)のがおすすめ。例を以下に示しておく。入力ファイルの細かい意味は別記事で解説するので乞うご期待!この入力ファイルでの計算はパソコンのコア数が20コアくらいで1日くらいかかるくらい大変なものです。実行にはご注意ください。

QuantumEspressoの入力ファイルの例

&CONTROL
  calculation = 'relax'
  forc_conv_thr = 1.0e-03
  nstep = 20
/
&SYSTEM
  ibrav = 0
  A =   10.73229
  nat = 74
  ntyp = 3

  ecutwfc = 25.0
  ecutrho = 225.0

  occupations = 'smearing'
  smearing = 'mp'
  degauss = 0.06
/
&ELECTRONS
  conv_thr = 1.0e-06
/
&IONS
  ion_dynamics = 'bfgs'
/
K_POINTS {automatic}
  4  4  2  0  0  0


CELL_PARAMETERS {alat}
  1.000000000000000   0.000000000000000   0.000000000000000 
  0.000000000000000   1.000000000000000   0.000000000000000 
  0.000000000000000   0.000000000000000   2.530201470478068 

ATOMIC_SPECIES
  Cu   63.54600  Cu.pbe-dn-kjpaw_psl.1.0.0.UPF
   C   12.01060   C.pbe-n-kjpaw_psl.1.0.0.UPF
   O   15.99900   O.pbe-n-kjpaw_psl.1.0.0.UPF

ATOMIC_POSITIONS {crystal}
Cu   0.000000000000000   0.000000000000000   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.000000000000000   0.000000000000000   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.000000000000000   0.333333333333333   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.000000000000000   0.333333333333333   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.000000000000000   0.666666666666667   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.000000000000000   0.666666666666667   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.333333333333333   0.000000000000000   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.333333333333333   0.000000000000000   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.333333333333333   0.333333333333333   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.333333333333333   0.333333333333333   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.333333333333333   0.666666666666667   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.333333333333333   0.666666666666667   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.666666666666667   0.000000000000000   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.666666666666667   0.000000000000000   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.666666666666667   0.333333333333333   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.666666666666667   0.333333333333333   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.666666666666667   0.666666666666667   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.666666666666667   0.666666666666667   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.000000000000000   0.166667000000000   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.000000000000000   0.166667000000000   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.000000000000000   0.500000000000000   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.000000000000000   0.500000000000000   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.000000000000000   0.833333000000000   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.000000000000000   0.833333000000000   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.333333333333333   0.166667000000000   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.333333333333333   0.166667000000000   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.333333333333333   0.500000000000000   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.333333333333333   0.500000000000000   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.333333333333333   0.833333000000000   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.333333333333333   0.833333000000000   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.666666666666667   0.166667000000000   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.666666666666667   0.166667000000000   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.666666666666667   0.500000000000000   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.666666666666667   0.500000000000000   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.666666666666667   0.833333000000000   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.666666666666667   0.833333000000000   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.166667000000000   0.000000000000000   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.166667000000000   0.000000000000000   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.166667000000000   0.333333333333333   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.166667000000000   0.333333333333333   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.166667000000000   0.666666666666667   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.166667000000000   0.666666666666667   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.500000000000000   0.000000000000000   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.500000000000000   0.000000000000000   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.500000000000000   0.333333333333333   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.500000000000000   0.333333333333333   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.500000000000000   0.666666666666667   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.500000000000000   0.666666666666667   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.833333000000000   0.000000000000000   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.833333000000000   0.000000000000000   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.833333000000000   0.333333333333333   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.833333000000000   0.333333333333333   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.833333000000000   0.666666666666667   0.065871000000000 	0	0	0
Cu   0.833333000000000   0.666666666666667   0.197613000000000 	0	0	0
Cu   0.166667000000000   0.166667000000000   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.166667000000000   0.166667000000000   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.166667000000000   0.500000000000000   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.166667000000000   0.500000000000000   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.166667000000000   0.833333000000000   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.166667000000000   0.833333000000000   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.500000000000000   0.166667000000000   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.500000000000000   0.166667000000000   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.500000000000000   0.500000000000000   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.500000000000000   0.500000000000000   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.500000000000000   0.833333000000000   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.500000000000000   0.833333000000000   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.833333000000000   0.166667000000000   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.833333000000000   0.166667000000000   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.833333000000000   0.500000000000000   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.833333000000000   0.500000000000000   0.131742000000000 	0	0	0
Cu   0.833333000000000   0.833333000000000   0.000000000000000 	0	0	0
Cu   0.833333000000000   0.833333000000000   0.131742000000000 	0	0	0
 O   0.666666666666667   0.500000000000000   0.298273000000000 	1	1	1
 C   0.666666666666667   0.500000000000000   0.260647000000000 	1	1	1